15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4324 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4324  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2746  hypothetical protein  52.48 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0861  protein of unknown function DUF930  43.43 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.496506 
 
 
-
 
NC_004310  BR0104  hypothetical protein  41.58 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0101  hypothetical protein  41.58 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0117  hypothetical protein  43.56 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.272132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0988  protein of unknown function DUF930  41.41 
 
 		 129 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0218  hypothetical protein  42.42 
 
 		 129 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.778956  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1259  hypothetical protein  43.43 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0170  hypothetical protein  34.34 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.034256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2954  protein of unknown function DUF930  35.56 
 
 		 245 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2696  protein of unknown function DUF930  34.44 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3101  hypothetical protein  30.77 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4161  hypothetical protein  33.01 
 
 		 294 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4313  hypothetical protein  28.72 
 
 		 317 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>