More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2693 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2693  arabinose phosphate phosphatase  100 
 
 
272 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3118  inositol-phosphate phosphatase  40.09 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4828  inositol monophosphatase  35.77 
 
 
269 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.244945  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3842  inositol-phosphate phosphatase  38.46 
 
 
269 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0717  inositol monophosphatase family protein  38.07 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0673  inositol monophosphatase family protein  35.06 
 
 
266 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2557  inositol-phosphate phosphatase  34.8 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462012  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0651  putative inositol monophosphatase protein  38.79 
 
 
264 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0295  inositol monophosphatase  33.94 
 
 
487 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2304  inositol-phosphate phosphatase  39.25 
 
 
264 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.116647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3411  Inositol-phosphate phosphatase  38.32 
 
 
262 aa  125  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1758  Inositol-phosphate phosphatase  36.82 
 
 
273 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0897515  normal  0.0157082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  32.14 
 
 
267 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3755  inositol-phosphate phosphatase  39.56 
 
 
266 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00081783  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  32.8 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0581  inositol-phosphate phosphatase  38.18 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1636  extragenic supressor  31.46 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  31.64 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1579  inositol-phosphate phosphatase  31.46 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0271512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  31.45 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  32.54 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  31.48 
 
 
275 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  30.68 
 
 
267 aa  116  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  31.76 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  30.68 
 
 
267 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  31.76 
 
 
267 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  31.76 
 
 
267 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  31.76 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  30.65 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4971  inositol monophosphatase  35.94 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  29.22 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0812  inositol monophosphatase  29.84 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3707  Inositol-phosphate phosphatase  34.23 
 
 
272 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000252692  hitchhiker  0.000000465281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  29.08 
 
 
283 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  30.59 
 
 
267 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  30.59 
 
 
267 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0967  Inositol-phosphate phosphatase  31.05 
 
 
264 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  30.59 
 
 
267 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  30.59 
 
 
267 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3968  inositol-phosphate phosphatase  33.33 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  32.67 
 
 
267 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  32.22 
 
 
261 aa  112  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  28.57 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0186  inositol-phosphate phosphatase  32.41 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  32.76 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  33.49 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  27.85 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  29.22 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1219  Inositol-phosphate phosphatase  33.04 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38679  predicted protein  35.37 
 
 
284 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1625  Inositol-phosphate phosphatase  35.11 
 
 
274 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1542  histidinol-phosphate phosphatase  32.44 
 
 
253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  32.93 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  30.52 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  32.67 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0538  Inositol-phosphate phosphatase  34.7 
 
 
277 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0555  inositol monophosphatase  34.7 
 
 
277 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.903783  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6136  inositol monophosphatase  35.78 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474979  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  32.52 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4316  inositol-phosphate phosphatase  32.11 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.866309 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1174  inositol-phosphate phosphatase  30.05 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  30.24 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  30.24 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  30.24 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  30.24 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  30.24 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  30.24 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  30.24 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  30.24 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6070  inositol monophosphatase  33.96 
 
 
283 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.712503  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2598  inositol monophosphatase  31.8 
 
 
309 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.624255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  30.24 
 
 
267 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  29.3 
 
 
268 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2096  inositol monophosphatase  36.36 
 
 
254 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  33.49 
 
 
271 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  30.24 
 
 
267 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4507  inositol monophosphatase  35.24 
 
 
247 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0929  inositol monophosphatase  41.54 
 
 
276 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14480  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  32.27 
 
 
262 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.17808 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  31.45 
 
 
270 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2586  Inositol-phosphate phosphatase  34.51 
 
 
260 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000081525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  32.7 
 
 
270 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  29.3 
 
 
267 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  31.19 
 
 
267 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  31.19 
 
 
267 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  31.19 
 
 
267 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  31.54 
 
 
264 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0546  Inositol-phosphate phosphatase  31.09 
 
 
266 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  28.69 
 
 
261 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  28.69 
 
 
261 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  31.6 
 
 
268 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  32.57 
 
 
271 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0756  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.14 
 
 
274 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  32.96 
 
 
266 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4536  inositol-phosphate phosphatase  33.33 
 
 
263 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  28.97 
 
 
268 aa  105  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  30.24 
 
 
267 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15221  hypothetical protein  33.21 
 
 
295 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  30.24 
 
 
267 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  30.24 
 
 
267 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>