More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3755 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3755  inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00081783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0717  inositol monophosphatase family protein  74.44 
 
 		 266 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3842  inositol-phosphate phosphatase  75.38 
 
 		 269 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0673  inositol monophosphatase family protein  74.06 
 
 		 266 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3118  inositol-phosphate phosphatase  66.28 
 
 		 262 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1758  Inositol-phosphate phosphatase  66.92 
 
 		 273 aa  353  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0897515  normal  0.0157082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0651  putative inositol monophosphatase protein  54.22 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102774  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2304  inositol-phosphate phosphatase  53.82 
 
 		 264 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116647 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0581  inositol-phosphate phosphatase  53.41 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2557  inositol-phosphate phosphatase  55.73 
 
 		 269 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4828  inositol monophosphatase  53.36 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.244945  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1366  inositol-1(or 4)-monophosphatase  46.15 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1604  inositol-phosphate phosphatase  39.68 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0186  inositol-phosphate phosphatase  38.76 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6070  inositol monophosphatase  42.02 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.712503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  39.3 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0295  inositol monophosphatase  38.61 
 
 		 487 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3411  Inositol-phosphate phosphatase  38.96 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  37.25 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3679  inositol-phosphate phosphatase  41.18 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0412  inositol-phosphate phosphatase  37.13 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1934  Inositol-phosphate phosphatase  38.98 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3968  inositol-phosphate phosphatase  40.09 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  35.1 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  35.1 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1636  extragenic supressor  39.09 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1579  inositol-phosphate phosphatase  39.09 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0271512  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2169  inositol monophosphatase family protein  41.78 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2096  inositol monophosphatase  38.5 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  41.78 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  40.62 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  41.01 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  36.08 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  34.39 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  33.98 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2660  inositol-phosphate phosphatase  35.34 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000257513  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  37.16 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  33.76 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0222  inositol monophosphatase  33.6 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.320953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  36.71 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0246  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.6 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  36.73 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  38.18 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  37.28 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  39.07 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3784  inositol-phosphate phosphatase  35.74 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000469077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  35.97 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  35.16 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  35.16 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0948  histidinol-phosphate phosphatase  36.72 
 
 		 256 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  34.27 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.33 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  36.55 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.99 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  37.5 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  37.67 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0128  inositol monophosphatase  40.38 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  36.28 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  37.1 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  37.45 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1534  inositol monophosphatase  41.31 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0685889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  33.73 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0161  extragenic suppressor protein SuhB  39.5 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17708  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2693  arabinose phosphate phosphatase  38.04 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3507  inositol-phosphate phosphatase  38.78 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.991426  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  36.77 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  34.78 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  34.78 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.24 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  34.78 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  33.07 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  37.55 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2586  Inositol-phosphate phosphatase  39.33 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000081525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  36.48 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  33.74 
 
 		 267 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.7 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  33.07 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  37.55 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2605  inositol monophosphatase family protein  33.61 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1664  inositol-1-monophosphatase  33.61 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0475156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  35.87 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2553  inositol monophosphatase family protein  33.61 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  33.59 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  33.59 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3149  inositol-1-monophosphatase  33.61 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  33.59 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4316  inositol-phosphate phosphatase  36.72 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.866309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  32.4 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1441  inositol-1-monophosphatase  33.61 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  33.59 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  33.61 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  36.48 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  37.5 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  32.42 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  35.37 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  35.27 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  36.48 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  39.01 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  32.41 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  37.44 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>