92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1264 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1264  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0865  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.77 
 
 
321 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545544  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0993  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.99 
 
 
286 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.32 
 
 
296 aa  324  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435339  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2379  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.85 
 
 
264 aa  242  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0291007  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5250  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.23 
 
 
309 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.89 
 
 
295 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.986449 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0454  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.32 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1284  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.13 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2378  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.3 
 
 
318 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2152  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.92 
 
 
277 aa  192  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00497533  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0509  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.2 
 
 
298 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.95239 
 
 
-
 
NC_004310  BR0848  glyoxalase family protein  39.05 
 
 
263 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.23 
 
 
292 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144835  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0840  glyoxalase family protein  38.32 
 
 
263 aa  185  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.80853  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4217  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.43 
 
 
279 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4849  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.8 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00867525  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.85 
 
 
288 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3202  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.62 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.491196  hitchhiker  0.00000223234 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3698  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.87 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.92 
 
 
268 aa  178  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0159535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.92 
 
 
268 aa  178  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0559323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1199  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.98 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2714  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.29 
 
 
313 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.64 
 
 
299 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.986343  hitchhiker  0.00000540832 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2083  glyoxalase family protein  36.89 
 
 
265 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4207  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.02 
 
 
285 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3078  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.89 
 
 
285 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.48397  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1320  ring-cleavage extradiol dioxygenase  37.1 
 
 
272 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.467416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4104  glyoxalase family protein  33.81 
 
 
285 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.961997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4479  glyoxalase family protein  32.97 
 
 
285 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4440  glyoxalase family protein  33.81 
 
 
285 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0306  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.63 
 
 
302 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.102716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4093  glyoxalase family protein  33.81 
 
 
285 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.16842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4441  glyoxalase family protein  33.45 
 
 
285 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.35 
 
 
291 aa  158  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28714  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03820  predicted ring-cleavage extradiol dioxygenase  39.57 
 
 
333 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4491  glyoxalase family protein  33.45 
 
 
285 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0757  glyoxalase family protein  33.09 
 
 
285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2383  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.53 
 
 
260 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2080  glyoxalase family protein  37.04 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1138  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.32 
 
 
274 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.765541  normal  0.0390949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.46 
 
 
292 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3541  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96548e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3587  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3326  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3290  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3242  glyoxalase family protein  31.97 
 
 
302 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000934209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2225  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.06 
 
 
291 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000262017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3232  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 
302 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3639  glyoxalase family protein  30.95 
 
 
302 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.494862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3544  glyoxalase family protein  31.29 
 
 
302 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1677  glyoxalase family protein  31.29 
 
 
302 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0116177  decreased coverage  1.0305999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3546  glyoxalase family protein  30.95 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.190797  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1083  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.53 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.112579  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0337  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.57 
 
 
297 aa  132  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204085  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0982  ring-cleavage extradiol dioxygenase  36.45 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1794  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.7 
 
 
295 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0614  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.07 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0551  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.44 
 
 
230 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00304683  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0760  glyoxalase family protein  26.47 
 
 
265 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.863263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.88 
 
 
160 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.96 
 
 
188 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.894491  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.77 
 
 
182 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1278  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
265 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1253  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
265 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.1 
 
 
165 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0290  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.78 
 
 
165 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0505928  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.78 
 
 
161 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0104076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4060  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.25 
 
 
165 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.25 
 
 
160 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.44 
 
 
167 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.93 
 
 
176 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.92062  normal  0.0694487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2217  hypothetical protein  37.68 
 
 
159 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.68 
 
 
159 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4256  glyoxase; glyoxalase/bleomycin resistance protein  39.39 
 
 
146 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.76 
 
 
159 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.088352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
178 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.824084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5141  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.51 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0668  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.93 
 
 
162 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4255  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5788  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 
155 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0683068  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.94 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.93 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1325  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 
123 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2679  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 
137 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2126  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 
139 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.79 
 
 
367 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.97 
 
 
204 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3062  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.51 
 
 
171 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0224113  normal  0.0364236 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0168  glyoxalase family protein  26.95 
 
 
149 aa  42.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766219  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0174  glyoxalase family protein  27.34 
 
 
134 aa  42.4  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>