86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_03820  predicted ring-cleavage extradiol dioxygenase  100 
 
 
333 aa  661    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0306  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62 
 
 
302 aa  348  8e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.102716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
292 aa  331  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.56 
 
 
291 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0337  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.9 
 
 
297 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3202  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.35 
 
 
308 aa  278  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.491196  hitchhiker  0.00000223234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2225  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.21 
 
 
291 aa  275  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000262017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2714  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.87 
 
 
313 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.7 
 
 
295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.986449 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0454  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.72 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2379  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.75 
 
 
264 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0291007  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3078  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.37 
 
 
285 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.48397  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.72 
 
 
288 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5250  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.64 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1199  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
287 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4207  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.21 
 
 
285 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.55 
 
 
268 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0559323  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.55 
 
 
268 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0159535  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4217  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.68 
 
 
279 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4479  glyoxalase family protein  34.08 
 
 
285 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4441  glyoxalase family protein  34.83 
 
 
285 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0757  glyoxalase family protein  34.08 
 
 
285 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1677  glyoxalase family protein  33.56 
 
 
302 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0116177  decreased coverage  1.0305999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4491  glyoxalase family protein  34.46 
 
 
285 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4104  glyoxalase family protein  34.46 
 
 
285 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.961997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3639  glyoxalase family protein  32.64 
 
 
302 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.494862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4440  glyoxalase family protein  34.83 
 
 
285 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3546  glyoxalase family protein  33.45 
 
 
302 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.190797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4093  glyoxalase family protein  34.83 
 
 
285 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.16842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4849  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41 
 
 
293 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00867525  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3242  glyoxalase family protein  33 
 
 
302 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000934209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3541  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96548e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3587  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3290  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3326  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1284  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.91 
 
 
267 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3544  glyoxalase family protein  32.99 
 
 
302 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3232  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.22 
 
 
302 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0509  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.26 
 
 
298 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.95239 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0865  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.03 
 
 
321 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545544  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.03 
 
 
292 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144835  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1264  hypothetical protein  39.57 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.02 
 
 
299 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.986343  hitchhiker  0.00000540832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2378  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.4 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3698  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.06 
 
 
305 aa  145  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0993  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 
286 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0848  glyoxalase family protein  37.66 
 
 
263 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0840  glyoxalase family protein  37.23 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.80853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1138  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.2 
 
 
274 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.765541  normal  0.0390949 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2152  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.06 
 
 
277 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00497533  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.92 
 
 
296 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435339  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1794  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.08 
 
 
295 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2083  glyoxalase family protein  33.73 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0614  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.42 
 
 
304 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1083  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.02 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.112579  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0551  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.59 
 
 
230 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00304683  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2383  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.22 
 
 
260 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2080  glyoxalase family protein  31.4 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1320  ring-cleavage extradiol dioxygenase  31.68 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.467416  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1253  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.82 
 
 
265 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1278  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.82 
 
 
265 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0982  ring-cleavage extradiol dioxygenase  30.92 
 
 
249 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0668  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.37 
 
 
162 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0290  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.03 
 
 
165 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0505928  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0760  glyoxalase family protein  24.89 
 
 
265 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.863263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.84 
 
 
176 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.92062  normal  0.0694487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4256  glyoxase; glyoxalase/bleomycin resistance protein  35.51 
 
 
146 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.58 
 
 
165 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.84 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.824084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.05 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0104076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5141  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.84 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2217  hypothetical protein  42.86 
 
 
159 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.46 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.23 
 
 
159 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.088352 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.14 
 
 
159 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4255  hypothetical protein  43.82 
 
 
133 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.43 
 
 
160 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.22 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.894491  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.83 
 
 
167 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4060  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
165 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.78 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5788  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.08 
 
 
155 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0683068  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 
217 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 
204 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.61 
 
 
201 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2053  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.8 
 
 
181 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.573082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>