46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4390 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4390  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  512  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1647  type 11 methyltransferase  73.11 
 
 
239 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3190  methyltransferase type 11  61.38 
 
 
245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5133  Methyltransferase type 11  58.82 
 
 
242 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.90914  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0496  hypothetical protein  49.09 
 
 
229 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
254 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.72 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  30.9 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  28.82 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  26.7 
 
 
256 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  27.33 
 
 
285 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
415 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  27.15 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  27.15 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
225 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
305 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
305 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  24.16 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  30 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  28.48 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
315 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  26.19 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  24.12 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
331 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0798  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.93 
 
 
203 aa  43.5  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.63 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.32 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.04 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.04 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  25.57 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.9 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  24.34 
 
 
223 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  25.83 
 
 
2867 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
257 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
250 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  26 
 
 
267 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  28.66 
 
 
250 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  28.66 
 
 
250 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.2 
 
 
558 aa  41.6  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.01 
 
 
255 aa  42  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>