15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2190 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2190  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  513  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39460  hypothetical protein  32.02 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38140  hypothetical protein  31.7 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6402  hypothetical protein  32.24 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6899  hypothetical protein  30.19 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35660  hypothetical protein  34.29 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.335426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6816  hypothetical protein  29.22 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6866  hypothetical protein  27.75 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35670  hypothetical protein  30.93 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.222488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1531  hypothetical protein  27.1 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30840  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24990  hypothetical protein  29.95 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35450  hypothetical protein  31.87 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.545265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01430  hypothetical protein  27.52 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0268047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4520  hypothetical protein  32.29 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>