17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35670  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.222488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35660  hypothetical protein  42.48 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.335426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1531  hypothetical protein  32.35 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6218  hypothetical protein  32.83 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6816  hypothetical protein  28.41 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24990  hypothetical protein  33.87 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6866  hypothetical protein  30.86 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0151  hypothetical protein  32.82 
 
 		 252 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01430  hypothetical protein  27.91 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0268047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38140  hypothetical protein  32.82 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6899  hypothetical protein  30.08 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6402  hypothetical protein  30.08 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4520  hypothetical protein  32.95 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2190  hypothetical protein  30.93 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3482  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  28.69 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01870  hypothetical protein  26.97 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39460  hypothetical protein  27.91 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.229524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>