13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01430 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01430  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0268047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6816  hypothetical protein  39.77 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35660  hypothetical protein  32.06 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.335426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24990  hypothetical protein  29.3 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6218  hypothetical protein  29.77 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6402  hypothetical protein  32.14 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6866  hypothetical protein  26.69 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35670  hypothetical protein  27.91 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.222488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1531  hypothetical protein  27.35 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6899  hypothetical protein  25.98 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38140  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4520  hypothetical protein  25.3 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2190  hypothetical protein  27.52 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>