16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35660 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35660  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.335426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35670  hypothetical protein  42.48 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.222488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6218  hypothetical protein  34.69 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01430  hypothetical protein  32.06 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0268047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38140  hypothetical protein  31.58 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6816  hypothetical protein  28.9 
 
 		 266 aa  85.5  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6866  hypothetical protein  31.18 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6402  hypothetical protein  29 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1531  hypothetical protein  31.11 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24990  hypothetical protein  28.35 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6899  hypothetical protein  30.15 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2190  hypothetical protein  34.29 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4520  hypothetical protein  29.28 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0151  hypothetical protein  27.5 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01870  hypothetical protein  31.46 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3482  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  26.84 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>