30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1063 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1063  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  156  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0979  glycine betaine transporter periplasmic subunit  97.37 
 
 		 359 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.84837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3478  glycine betaine transporter periplasmic subunit  59.09 
 
 		 335 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.688917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3322  glycine betaine transporter periplasmic subunit  56.82 
 
 		 335 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2477  glycine betaine transporter periplasmic subunit  62 
 
 		 343 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2519  glycine betaine transporter periplasmic subunit  52.54 
 
 		 336 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2666  glycine betaine transporter periplasmic subunit  55.17 
 
 		 348 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00589435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1495  glycine betaine transporter periplasmic subunit  76.92 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0772797  normal  0.339425 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0895  glycine betaine transporter periplasmic subunit  50 
 
 		 331 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0863  glycine betaine transporter periplasmic subunit  48.84 
 
 		 332 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3117  glycine betaine transporter periplasmic subunit  72 
 
 		 331 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.293613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2994  glycine betaine transporter periplasmic subunit  72 
 
 		 331 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.805  hitchhiker  0.00724532 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003611  L-proline glycine betaine binding ABC transporter protein proX/osmotic adaptation  62.96 
 
 		 312 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0614  glycine betaine transporter periplasmic subunit  47.73 
 
 		 335 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3736  glycine betaine transporter periplasmic subunit  72 
 
 		 333 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3200  glycine betaine transporter periplasmic subunit  72 
 
 		 330 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3011  glycine betaine transporter periplasmic subunit  68 
 
 		 331 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2960  glycine betaine transporter periplasmic subunit  72 
 
 		 330 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02535  glycine betaine transporter subunit  72 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2959  glycine betaine transporter periplasmic subunit  68 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0307934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2928  glycine betaine transporter periplasmic subunit  68 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2801  glycine betaine transporter periplasmic subunit  72 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0222237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3923  glycine betaine transporter periplasmic subunit  72 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.334646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1027  glycine betaine transporter periplasmic subunit  72 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3534  glycine betaine transporter periplasmic subunit  72 
 
 		 326 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0200308 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02499  hypothetical protein  72 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2815  glycine betaine transporter periplasmic subunit  72 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3159  glycine betaine transporter periplasmic subunit  64 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.138504  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1004  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  72 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1059  glycine betaine transporter periplasmic subunit  72 
 
 		 334 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>