24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_4099 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4099  transport-associated protein  100 
 
 
142 aa  273  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0500  transport-associated protein  43.79 
 
 
149 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0596  transport-associated protein  28.38 
 
 
153 aa  67  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5138  transport-associated protein  29.8 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.874343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4935  transport-associated  26.9 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0636  transport-associated  29.27 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  41.89 
 
 
205 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  41.89 
 
 
205 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  41.89 
 
 
205 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  41.89 
 
 
205 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  41.89 
 
 
205 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  42.47 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  42.47 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  41.79 
 
 
201 aa  42.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  42.47 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  42.47 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  42.47 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  42.47 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  42.19 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  41.79 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  42.47 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  42.47 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  41.38 
 
 
202 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  41.38 
 
 
202 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>