13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0500 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0500  transport-associated protein  100 
 
 		 149 aa  288  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4099  transport-associated protein  43.79 
 
 		 142 aa  100  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5138  transport-associated protein  30.2 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.874343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4935  transport-associated  28.57 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0596  transport-associated protein  30.92 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0636  transport-associated  31.76 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  36.84 
 
 		 205 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  35.71 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  35.71 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  35.71 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  35.71 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  35.71 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  37.5 
 
 		 201 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>