75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1853 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1853  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  388  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.73 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  33.94 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  34.25 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  27.81 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  31.25 
 
 
223 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1305  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.17 
 
 
200 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2423  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.14 
 
 
194 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  31.31 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  32.79 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  32.6 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.8 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.8 
 
 
209 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01839  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  54.7  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.009571  normal  0.645979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.51 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.93 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  29.01 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.56 
 
 
195 aa  51.2  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.69 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  31.69 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  31.69 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03640  membrane protein, putative  31.82 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0291661  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  31.69 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.34 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  30.39 
 
 
188 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  31.28 
 
 
188 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.69 
 
 
207 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.16 
 
 
183 aa  47.8  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  26.95 
 
 
257 aa  48.1  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  30.39 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  29.71 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  30.39 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  30.39 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  26.59 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  30.39 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.43 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  30.48 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  29.2 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  29.73 
 
 
188 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  30.48 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  30.48 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.48 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  26.95 
 
 
203 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  30.48 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  30.48 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.79 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.63 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.56 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1253  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.14 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284277  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  30.48 
 
 
188 aa  45.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  28.32 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.79 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.93 
 
 
189 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.93 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  30.39 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  29.95 
 
 
188 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.1 
 
 
189 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33707  predicted protein  30.43 
 
 
274 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.373247  hitchhiker  0.000185367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  28.93 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.68 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  25 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.1 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  29.65 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.1 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.27 
 
 
187 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1006  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.27 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0753776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3283  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.27 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0944573 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  30.77 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.27 
 
 
187 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.15 
 
 
186 aa  42  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  30.77 
 
 
197 aa  42  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2835  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.81 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.244228  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  30.49 
 
 
189 aa  41.2  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07317  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 
221 aa  41.2  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0696491  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>