34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1429 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1429  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 
203 aa  377  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1331  purine-nucleoside phosphorylase  97.52 
 
 
203 aa  291  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.182978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2522  purine-nucleoside phosphorylase  94.87 
 
 
199 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1740  hypothetical protein  79.26 
 
 
200 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.562339 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1815  purine nucleoside phosphorylase  25.15 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0060  hypothetical protein  26.06 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1881  hypothetical protein  21.84 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0006  hypothetical protein  21.84 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0501907  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2086  hypothetical protein  21.26 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5287  Adenosylhomocysteine nucleosidase  32 
 
 
268 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  41.67 
 
 
231 aa  48.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0920  methylthioadenosine nucleosidase  41.67 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.103571  normal  0.199086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3137  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26.79 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.603402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1253  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.79 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1134  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.79 
 
 
231 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.459075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1220  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.4 
 
 
236 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2874  methylthioadenosine nucleosidase  27.35 
 
 
236 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.00179592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2956  methylthioadenosine nucleosidase  27.35 
 
 
236 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0322899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1322  5-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.13 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  30.36 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1176  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.19 
 
 
236 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.633739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4313  adenosylhomocysteine nucleosidase  34.43 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0020  conserved hypothetical protein, putative purine nucleoside phosphorylase  19.62 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3052  methylthioadenosine nucleosidase  24.61 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01627  5-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  45.83 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1115  adenosylhomocysteine nucleosidase  25 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0518  adenosylhomocysteine nucleosidase  43.75 
 
 
235 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0223  Adenosylhomocysteine nucleosidase  40.43 
 
 
279 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172084  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  36.73 
 
 
228 aa  42.4  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  39.58 
 
 
231 aa  42  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0927  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  34.62 
 
 
227 aa  42  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  36.07 
 
 
231 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1217  adenosylhomocysteine nucleosidase  34.29 
 
 
230 aa  41.6  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0451567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1027  methylthioadenosine nucleosidase  29.17 
 
 
230 aa  41.6  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>