1962 genes were found for organism Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 20    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
P9301_00001  CDS  NC_009091  170  1327  1158  DNA polymerase III subunit beta  YP_001090224  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00011  CDS  NC_009091  1329  2036  708  hypothetical protein  YP_001090225  decreased coverage  0.00151751  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00021  CDS  NC_009091  2040  4379  2340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  YP_001090226  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00031  CDS  NC_009091  4427  5887  1461  amidophosphoribosyltransferase  YP_001090227  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00041  CDS  NC_009091  5884  8325  2442  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  YP_001090228  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00051  CDS  NC_009091  8403  9266  864  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  YP_001090229  normal  0.589169  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00061  CDS  NC_009091  9263  10219  957  hypothetical protein  YP_001090230  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00071  CDS  NC_009091  10366  11100  735  hypothetical protein  YP_001090231  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00081  CDS  NC_009091  11104  11721  618  transcription antitermination protein NusB  YP_001090232  normal  0.874807  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00091  CDS  NC_009091  11784  13103  1320  signal recognition particle docking protein FtsY  YP_001090233  normal  0.290056  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00101  CDS  NC_009091  13171  14514  1344  protein phosphatase 2C domain-containing protein  YP_001090234  normal  0.0928709  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00111  CDS  NC_009091  14576  15955  1380  argininosuccinate lyase  YP_001090235  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00121  CDS  NC_009091  16071  16724  654  RNA recognition motif-containing protein  YP_001090236  normal  0.044748  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00131  CDS  NC_009091  16721  17725  1005  tRNA-dihydrouridine synthase A  YP_001090237  normal  0.0438823  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00141  CDS  NC_009091  17748  18242  495  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  YP_001090238  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00151  CDS  NC_009091  18317  19036  720  heat shock protein GrpE  YP_001090239  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00161  CDS  NC_009091  19066  20190  1125  chaperone protein DnaJ  YP_001090240  normal  0.453934  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00171  CDS  NC_009091  20190  20420  231  hypothetical protein  YP_001090241  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00181  CDS  NC_009091  20410  21327  918  GTPase  YP_001090242  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00191  CDS  NC_009091  21293  21643  351  hypothetical protein  YP_001090243  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00201  CDS  NC_009091  21661  22554  894  UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase  YP_001090244  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00211  CDS  NC_009091  22570  23916  1347  UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase  YP_001090245  normal  0.0188259  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00221  CDS  NC_009091  24170  25192  1023  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase(NADP+)(phosphorylating)  YP_001090246  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00231  CDS  NC_009091  25193  26179  987  putative thiamine-monophosphate kinase  YP_001090247  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00241  CDS  NC_009091  26172  27263  1092  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001090248  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00251  CDS  NC_009091  27307  27867  561  elongation factor P  YP_001090249  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00261  CDS  NC_009091  27867  28373  507  biotin / lipoyl attachment:Acetyl-CoA biotin carboxyl carrier subunit  YP_001090250  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00271  CDS  NC_009091  28350  29339  990  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  YP_001090251  normal  0.204744  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00281  CDS  NC_009091  29404  30282  879  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  YP_001090252  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00291  CDS  NC_009091  30315  30545  231  transcription factor TFIID (or TATA-b)  YP_001090253  normal  0.445259  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00301  CDS  NC_009091  30546  30947  402  HNH endonuclease:HNH nuclease  YP_001090254  normal  0.285669  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00311  CDS  NC_009091  31114  31566  453  type II secretion system protein-like protein  YP_001090255  normal  0.105895  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00321  CDS  NC_009091  31623  32135  513  hypothetical protein  YP_001090256  normal  0.0537644  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00331  CDS  NC_009091  32269  32466  198  hypothetical protein  YP_001090257  normal  0.520851  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00341  CDS  NC_009091  32468  33631  1164  soluble hydrogenase small subunit  YP_001090258  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00351  CDS  NC_009091  33692  34804  1113  cobalt-precorrin-6A synthase  YP_001090259  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00361  CDS  NC_009091  34859  36445  1587  GMP synthase  YP_001090260  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00371  CDS  NC_009091  36630  36947  318  hypothetical protein  YP_001090261  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00381  CDS  NC_009091  37790  39103  1314  hypothetical protein  YP_001090262  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00391  CDS  NC_009091  39429  40937  1509  TPR repeat-containing protein  YP_001090263  normal  0.264497  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00401  CDS  NC_009091  41480  42193  714  hypothetical protein  YP_001090264  normal  0.170311  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00411  CDS  NC_009091  42273  42881  609  hypothetical protein  YP_001090265  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00421  CDS  NC_009091  42990  43133  144  hypothetical protein  YP_001090266  normal  0.114434  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00431  CDS  NC_009091  43289  44935  1647  putative penicillin-binding protein  YP_001090267  normal  0.876633  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00441  CDS  NC_009091  44958  45482  525  putative reductase  YP_001090268  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00451  CDS  NC_009091  45500  47302  1803  flavoprotein  YP_001090269  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00461  CDS  NC_009091  47319  49094  1776  flavoprotein  YP_001090270  normal  0.551818  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00471  CDS  NC_009091  49214  51874  2661  alanyl-tRNA synthetase  YP_001090271  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00481  CDS  NC_009091  51859  53805  1947  arginine decarboxylase  YP_001090272  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00491  CDS  NC_009091  53928  54386  459  nucleoside diphosphate kinase  YP_001090273  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00501  CDS  NC_009091  54390  55499  1110  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  YP_001090274  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00511  CDS  NC_009091  55606  57051  1446  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B  YP_001090275  normal  0.259436  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00521  CDS  NC_009091  57055  57672  618  dephospho-CoA kinase  YP_001090276  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00531  CDS  NC_009091  57749  58987  1239  bifunctional ornithine acetyltransferase/N-acetylglutamate synthase protein  YP_001090277  normal  0.364181  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00541  CDS  NC_009091  59311  62076  2766  hypothetical protein  YP_001090278  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00551  CDS  NC_009091  62086  62832  747  hypothetical protein  YP_001090279  normal  0.276796  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00561  CDS  NC_009091  62819  63253  435  hypothetical protein  YP_001090280  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00571  CDS  NC_009091  63318  63758  441  hypothetical protein  YP_001090281  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00581  CDS  NC_009091  63799  63954  156  hypothetical protein  YP_001090282  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00591  CDS  NC_009091  64299  64970  672  chromosome partitioning ATPase protein  YP_001090283  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00601  CDS  NC_009091  65120  66082  963  aldo/keto reductase  YP_001090284  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00611  CDS  NC_009091  66091  66228  138  hypothetical protein  YP_001090285  normal  0.281081  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00621  CDS  NC_009091  66707  67831  1125  RNA methylase family protein  YP_001090286  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00631  CDS  NC_009091  67833  68219  387  hypothetical protein  YP_001090287  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00641  CDS  NC_009091  68221  68682  462  hypothetical protein  YP_001090288  normal  0.761097  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00651  CDS  NC_009091  68849  68974  126  hypothetical protein  YP_001090289  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00661  CDS  NC_009091  68853  69008  156  hypothetical protein  YP_001090290  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00671  CDS  NC_009091  69089  69451  363  hypothetical protein  YP_001090291  normal  0.603179  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00681  CDS  NC_009091  69528  73118  3591  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  YP_001090292  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00691  CDS  NC_009091  73164  74231  1068  hypothetical protein  YP_001090293  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00701  CDS  NC_009091  74235  75521  1287  lipid A disaccharide synthetase-like protein  YP_001090294  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00711  CDS  NC_009091  75867  77216  1350  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  YP_001090295  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00721  CDS  NC_009091  77235  77540  306  hypothetical protein  YP_001090296  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00731  CDS  NC_009091  77631  77816  186  photosystem II protein X PsbX  YP_001090297  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00741  CDS  NC_009091  77896  78825  930  hypothetical protein  YP_001090298  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00751  CDS  NC_009091  78826  79101  276  high light inducible protein  YP_001090299  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00761  CDS  NC_009091  79110  81092  1983  ABC transporter, ATP binding protein  YP_001090300  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00771  CDS  NC_009091  81135  81413  279  hypothetical protein  YP_001090301  normal  0.581166  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00781  CDS  NC_009091  81460  81801  342  HIT (histidine triad) family protein  YP_001090302  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00791  CDS  NC_009091  81806  82411  606  peptide deformylase  YP_001090303  normal  0.503942  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00801  CDS  NC_009091  82492  84417  1926  esterase/lipase/thioesterase family protein  YP_001090304  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00811  CDS  NC_009091  84414  85667  1254  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  YP_001090305  normal  0.368532  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00821  CDS  NC_009091  85667  86884  1218  ABC transporter, membrane component  YP_001090306  normal  0.714133  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00831  CDS  NC_009091  86889  87674  786  ABC transporter, ATP binding component  YP_001090307  normal  0.664589  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00841  CDS  NC_009091  87692  89194  1503  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  YP_001090308  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00851  CDS  NC_009091  89231  89584  354  hypothetical protein  YP_001090309  normal  0.565376  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00861  CDS  NC_009091  89872  90957  1086  hypothetical protein  YP_001090310  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00871  CDS  NC_009091  90970  91140  171  membrane protein  YP_001090311  normal  0.461596  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00881  CDS  NC_009091  91173  92810  1638  phosphoglucomutase  YP_001090312  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00891  CDS  NC_009091  92844  94133  1290  recombination factor protein RarA  YP_001090313  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00901  CDS  NC_009091  94130  94813  684  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  YP_001090314  normal  0.125228  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00911  CDS  NC_009091  94786  95253  468  putative bacterioferritin comigratory (BCP) protein  YP_001090315  normal  0.376517  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00921  CDS  NC_009091  95245  95940  696  transcriptional regulator  YP_001090316  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00931  CDS  NC_009091  95956  96678  723  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  YP_001090317  normal  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00941  CDS  NC_009091  96774  97967  1194  putative NADH dehydrogenase, transport associated  YP_001090318  normal  0.718814  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00951  CDS  NC_009091  98017  99825  1809  DASS family sodium/sulfate transporter  YP_001090319  normal  0.8674  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00961  CDS  NC_009091  99830  101233  1404  Trk family sodium transporter  YP_001090320  normal  0.419484  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00971  CDS  NC_009091  101252  101956  705  VIC family potassium channel protein  YP_001090321  normal  0.0321337  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00981  CDS  NC_009091  101963  102265  303  hypothetical protein  YP_001090322  normal  0.320326  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
P9301_00991  CDS  NC_009091  102383  102721  339  hypothetical protein  YP_001090323  normal  0.367363  n/a    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 20    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>