263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Leu-3 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0025  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0645  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.481512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0047  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.398541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0058  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0074  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0069  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365522  normal  0.0296897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0070  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0056  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0070  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0026  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00329777  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0011  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0552759  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0018  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0066  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.421355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna35  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0045  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102095 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0018  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0077  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0035  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.671862 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0016  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0052  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62800  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60360  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0033  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735021  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0017  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0065  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA39  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.220768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5466  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138574  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00069  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000211563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0001  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00086  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0554728  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0010  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0080  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.02179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3470  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00513731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0035  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4728  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212107  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0029  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4701  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000616666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0028  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.179122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0032    90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.333089  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0003  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0687845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0051  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00811518  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0012  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313153 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0034  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.956529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4916  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000645766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0044  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0171508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0005  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000329783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0028  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0047  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.279454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0036  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0052  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888943  normal  0.34403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4161  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000230562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0035  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4957  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4958  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0095  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0436868  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4915  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000252066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu04  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.353437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0037  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4163  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000225021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0094  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0443375  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3989  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309185  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0718906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0025  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116004  normal  0.383928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0030  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0029  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.322054 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5115  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0527  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000711336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5114  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0841  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0016  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00811405  normal  0.0178437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0017  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00783085  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0018  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0174601  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0082  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000269162  normal  0.128864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0095  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000279268  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1764  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000024558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1768  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1772  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>