54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0107 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  315  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  38.46 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  37.76 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  37.76 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  35.9 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  37.76 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  36.02 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  39.46 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  37.06 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  36.93 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  37.43 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  35.76 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  34.27 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  34.27 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  31.76 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  35.97 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  33.57 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  31.97 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  34.04 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  31.37 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  31.37 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  37.06 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  30.25 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1692  hypothetical protein  31.79 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  34.64 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  29.75 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  26.57 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  34.06 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  31.43 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  29.11 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  29.11 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  27.59 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  28.48 
 
 		 158 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  28.48 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  30 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  32.37 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  29.29 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  26.35 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  29.81 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  28.77 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  28.3 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  28.68 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  32.19 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  30.99 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  28.48 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  27.39 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  29.33 
 
 		 277 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 281 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C09  transcription activator effector binding domain-containing protein  28.45 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  23.74 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 280 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  27.74 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>