24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1638 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1638  phage-related integrase  100 
 
 		 129 aa  266  7e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1581  hypothetical protein  96.33 
 
 		 109 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0915867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1893  phage-related integrase  78.75 
 
 		 179 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1144  hypothetical protein  64.29 
 
 		 70 aa  90.5  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  34.41 
 
 		 368 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2692  phage integrase  39.34 
 
 		 404 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.344187  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0473  integrase family protein  43.14 
 
 		 377 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  40.51 
 
 		 305 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  33.33 
 
 		 414 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  37.74 
 
 		 299 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  39.58 
 
 		 324 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  34.33 
 
 		 332 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  45.65 
 
 		 370 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  33.85 
 
 		 337 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  39.19 
 
 		 387 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  33.33 
 
 		 299 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  29.33 
 
 		 381 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  37.04 
 
 		 336 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  36.67 
 
 		 332 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 209 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  29.33 
 
 		 381 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  30.88 
 
 		 305 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  33.33 
 
 		 384 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  39.62 
 
 		 328 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>