11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1704 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1704  PilX protein  100 
 
 
164 aa  332  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1766  fimbrial assembly protein  98.17 
 
 
164 aa  327  4e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.132281  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01323  PilX  37.5 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1381  PilX protein  35.06 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296377  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  38.04 
 
 
164 aa  51.2  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  36.67 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0211  Tfp pilus assembly protein PilX  40 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.0360944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  46.3 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  35.16 
 
 
178 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  33.87 
 
 
221 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  34.48 
 
 
213 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>