31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4587 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  383  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  89.43 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  93.64 
 
 
210 aa  184  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  50.49 
 
 
106 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  45.38 
 
 
138 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0196  hypothetical protein  36.6 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  38.61 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  34.62 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  36.08 
 
 
172 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  31.19 
 
 
171 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  34.69 
 
 
180 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  34.69 
 
 
183 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  34.69 
 
 
180 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  31.96 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  31.96 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  32.32 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5457  hypothetical protein  31.58 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13043  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  31.63 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  30.93 
 
 
171 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  27.72 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  29.13 
 
 
314 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  32.32 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  29.9 
 
 
171 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0025  protein of unknown function DUF1520  28.42 
 
 
209 aa  45.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0007  hypothetical protein  28.42 
 
 
209 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.906518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  34.62 
 
 
152 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  31.63 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1872  hypothetical protein  30.6 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  36.89 
 
 
177 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  32.58 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>