17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3457 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4888  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  69.72 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  44.03 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  35.4 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  38.35 
 
 		 307 aa  70.5  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  36.96 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  34.91 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 177 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2306  MCP methyltransferase, CheR-type  31.19 
 
 		 470 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_003296  RS02206  putative methyltransferase protein  30.12 
 
 		 466 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2197  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>