17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3228 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3228  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445025  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1710  hypothetical protein  38.44 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  31.55 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4005  hypothetical protein  31.95 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1322  hypothetical protein  31.53 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1321  hypothetical protein  31.59 
 
 
361 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0176  hypothetical protein  26.34 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4263  hypothetical protein  29.73 
 
 
343 aa  62.8  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0340  hypothetical protein  26.82 
 
 
355 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586922  normal  0.321753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  28.42 
 
 
523 aa  56.2  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0842  hypothetical protein  26.15 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2338  hypothetical protein  26.71 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000404345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1738  hypothetical protein  22.82 
 
 
383 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.587497  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4234  hypothetical protein  30.43 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.768342  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3822  hypothetical protein  27.27 
 
 
310 aa  49.7  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3220  hypothetical protein  27.83 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2773  hypothetical protein  27.81 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>