22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2257 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2257  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  587  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0106481  hitchhiker  0.00981057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0036  hypothetical protein  58.7 
 
 
279 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3741  hypothetical protein  53.85 
 
 
282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.220518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5395  hypothetical protein  45.96 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  26.85 
 
 
391 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  27.33 
 
 
364 aa  62.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  31.61 
 
 
585 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  28.86 
 
 
390 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  30.2 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  28.87 
 
 
390 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  24.14 
 
 
383 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  28.17 
 
 
390 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  25.69 
 
 
393 aa  52.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  27.95 
 
 
384 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  26.28 
 
 
358 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  25.83 
 
 
358 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  28.57 
 
 
358 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  29.06 
 
 
386 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  27.63 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  25.17 
 
 
359 aa  49.3  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  22.89 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  24.84 
 
 
516 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>