43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1480 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  318  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  43.44 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  46.83 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  45 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  37.6 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  47.17 
 
 		 127 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1612  membrane protein DUF423  37.61 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221104  normal  0.524793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  46.34 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  48.94 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  37.17 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  46.9 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  38.84 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  40.16 
 
 		 123 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  45.45 
 
 		 123 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  49.09 
 
 		 131 aa  52.4  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  46.46 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  42.24 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  45.6 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04960  hypothetical protein  39.5 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0478  hypothetical protein  39.5 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324677  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  39.77 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5332  hypothetical protein  37.19 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.423162  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2013  protein of unknown function DUF423  30.43 
 
 		 125 aa  45.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  44.3 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0432  hypothetical protein  35.25 
 
 		 126 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  41.6 
 
 		 122 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4742  hypothetical protein  37.7 
 
 		 126 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14373  predicted protein  37.62 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0620  hypothetical protein  32.89 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0606  hypothetical protein  32.89 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0928  hypothetical protein  31.2 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2261  protein of unknown function DUF423  34.71 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.328273  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0230  hypothetical protein  28.7 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1903  protein of unknown function DUF423  38.46 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004250  hypothetical protein  34.48 
 
 		 132 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000539124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3177  hypothetical protein  32.74 
 
 		 128 aa  41.6  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0328  protein of unknown function DUF423  28.72 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.858167  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5156  hypothetical protein  38.84 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444342  normal  0.879938 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0355  hypothetical protein  32.08 
 
 		 121 aa  41.2  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000016256  hitchhiker  0.000400939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4979  hypothetical protein  38.84 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  30.4 
 
 		 131 aa  41.2  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5106  hypothetical protein  38.84 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.167348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0692  membrane protein  30.95 
 
 		 128 aa  40.8  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>