54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0121 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0121  putative ferredoxin, 2Fe-2S  100 
 
 		 104 aa  203  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.592235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5894  putative ferredoxin, 2Fe-2S  58 
 
 		 102 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313764  normal  0.9402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  51.52 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  57.45 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  53.76 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1905  ferredoxin  51.46 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  47.12 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0407  2Fe-2S ferredoxin  51.85 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934489  normal  0.311867 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  50.55 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1257  ferredoxin  47.12 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1541  ferredoxin, putative  47.12 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0216  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  35 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1564  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.96 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.11 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1439  (2FE-2S) ferredoxin  32.61 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101111  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.67 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  30.77 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1136  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.11 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1558  ferredoxin, 2Fe-2S type  27.66 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0549119  normal  0.219971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2574  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  27.66 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44606  hitchhiker  0.00922015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  31.31 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2257  putative ferredoxin (2Fe-2S) protein  30.11 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  31.31 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  31.31 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.87 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.72 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  30.85 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1661  ferredoxin, 2Fe-2S type  31.18 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.799662  hitchhiker  0.000531904 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.26 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3994  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.97 
 
 		 112 aa  42  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38929  normal  0.0257011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  27.66 
 
 		 112 aa  42  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  25.81 
 
 		 112 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  26.6 
 
 		 113 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  27.17 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1030  ferredoxin, 2Fe-2S type  28.72 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891184  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  27.96 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1064  ferredoxin, 2Fe-2S type  29.03 
 
 		 112 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.975395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.79 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.79 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0444607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1482  putative ferredoxin, 2Fe-2S type  30.11 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  30.11 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1042  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.35 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2147  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  27.72 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.442725  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  25.53 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  25.53 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  25.53 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1634  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.9 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2158  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  25.53 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1453  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  25.53 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.821654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2031  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  25.53 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2183  ferredoxin, 2Fe-2S type  31.18 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  25.69 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  25.49 
 
 		 112 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>