More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4033 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4033  ATPase  100 
 
 
339 aa  686    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3278  MoxR protein, putative  79.65 
 
 
339 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3047  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  78.47 
 
 
339 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2421  putative MxaR-like protein  77.58 
 
 
339 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868605  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  72.57 
 
 
339 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1525  moxR protein, putative  62.28 
 
 
342 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0519563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  58.63 
 
 
338 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  59.94 
 
 
343 aa  421  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.94 
 
 
343 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4628  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.94 
 
 
343 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.86 
 
 
345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1896  MoxR protein, putative  57.14 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.155762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  56.89 
 
 
343 aa  401  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2040  ATPase  53.89 
 
 
339 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0783  moxR protein  58.41 
 
 
339 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.587731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1911  ATPase  56.16 
 
 
356 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  59.76 
 
 
334 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8036  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.27 
 
 
343 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  53.98 
 
 
339 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2997  ATPase  52.08 
 
 
339 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  33.92 
 
 
385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  34.23 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1942  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.14 
 
 
322 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  34.23 
 
 
390 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  34.23 
 
 
390 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  34.23 
 
 
390 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  31.49 
 
 
327 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  35.17 
 
 
337 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  32.24 
 
 
327 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  33.94 
 
 
377 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  35.45 
 
 
327 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  33.73 
 
 
347 aa  156  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  34.62 
 
 
318 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  35.8 
 
 
319 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.31 
 
 
354 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  34.94 
 
 
336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  31.58 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  32.17 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.88 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  31.29 
 
 
331 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  33.43 
 
 
326 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.36 
 
 
319 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  34.02 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  30.56 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  33.64 
 
 
319 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  35.14 
 
 
358 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  36.18 
 
 
324 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  34.69 
 
 
319 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  34.38 
 
 
319 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  31.92 
 
 
326 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  33.63 
 
 
318 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  34.06 
 
 
319 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  34.69 
 
 
303 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  35.89 
 
 
339 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  34.38 
 
 
319 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  32.94 
 
 
359 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  34.05 
 
 
344 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.14 
 
 
335 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  34.45 
 
 
345 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  34.06 
 
 
319 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  34.06 
 
 
319 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  34.06 
 
 
319 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  37.12 
 
 
322 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  31.38 
 
 
327 aa  150  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.14 
 
 
329 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.34 
 
 
356 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  32.35 
 
 
318 aa  149  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.34 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.42 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  34.36 
 
 
370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  33.54 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  33.74 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  32.09 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  32 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  31.96 
 
 
321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  32.89 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.13 
 
 
378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.63 
 
 
322 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  33.44 
 
 
326 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.21 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  31.74 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  33.64 
 
 
320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.23 
 
 
327 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.34 
 
 
325 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  34.67 
 
 
325 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1090  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.75 
 
 
327 aa  146  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  34.48 
 
 
319 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.69 
 
 
333 aa  146  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  33.13 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.23 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  31.5 
 
 
334 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.92 
 
 
318 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.05 
 
 
332 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.75 
 
 
332 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0462  MoxR family ATPase  30.06 
 
 
343 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  33.44 
 
 
303 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  32.87 
 
 
303 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  31.43 
 
 
340 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  33.84 
 
 
339 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  34.34 
 
 
329 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>