14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2640 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2640  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698149  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4111  hypothetical protein  60.94 
 
 
235 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  61.33 
 
 
236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0723  hypothetical protein  52.5 
 
 
242 aa  265  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0606  hypothetical protein  57.46 
 
 
238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3155  hypothetical protein  51.45 
 
 
250 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.010692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3450  hypothetical protein  46.02 
 
 
237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0651  hypothetical protein  30.38 
 
 
244 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000628149  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0383  hypothetical protein  31.08 
 
 
251 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216107  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0368  hypothetical protein  30.68 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0593824  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0492  hypothetical protein  32.27 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  31.17 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  24.79 
 
 
258 aa  62.4  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  25.93 
 
 
232 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>