39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2124 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
493 aa  982    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  46.2 
 
 
483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  34.52 
 
 
459 aa  223  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  34.34 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  35.81 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  34.37 
 
 
468 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  33.81 
 
 
453 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  35.31 
 
 
461 aa  200  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  35.91 
 
 
515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  33.47 
 
 
456 aa  195  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  32.73 
 
 
475 aa  190  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  31.57 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  28.3 
 
 
474 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  26.81 
 
 
447 aa  93.6  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  24.52 
 
 
460 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  22.88 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  24.53 
 
 
467 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  24.75 
 
 
474 aa  57  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  25 
 
 
538 aa  53.5  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  26.48 
 
 
515 aa  50.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  24.9 
 
 
505 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  20.88 
 
 
497 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3072  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.34 
 
 
556 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.317516  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  23.48 
 
 
496 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  24.55 
 
 
472 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  26.03 
 
 
508 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  24.55 
 
 
472 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.34 
 
 
509 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  22.22 
 
 
494 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  24.19 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  24.46 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  24.61 
 
 
515 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  24.55 
 
 
472 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  25.71 
 
 
498 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  22.22 
 
 
494 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  20.96 
 
 
497 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2076  carbohydrate kinase, FGGY  27.92 
 
 
500 aa  44.3  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00125408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  26.21 
 
 
477 aa  43.9  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  27.35 
 
 
486 aa  43.5  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>