37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5451 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 92 aa  185  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  44.05 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  38.82 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  37.31 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  35.62 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2343  hypothetical protein  38.75 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  30.95 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2017  hypothetical protein  36.25 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  34.72 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  36.11 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0240  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  32.43 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0177  prevent-host-death family protein  35 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  36.11 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  35.62 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08232  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000278747  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  34.72 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2237  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.265001  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1279  prevent-host-death family protein  33.75 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0125  addiction module antitoxin  41.43 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.17666e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  33.82 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4645  prevent-host-death protein  32.91 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2740  prevent-host-death family protein  39.73 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  31.25 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04765  hypothetical protein  29.63 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2468  prevent-host-death family protein  30.12 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13710  prevent-host-death family protein  36.92 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000922616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2346  prevent-host-death family protein  41.3 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.940595 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  33.8 
 
 		 93 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1410  hypothetical protein  29.41 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185116  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4124  prevent-host-death family protein  39.29 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000234799  hitchhiker  0.00000000380976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>