34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2468 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2468  prevent-host-death family protein  100 
 
 
103 aa  207  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0751  prevent-host-death family protein  69.15 
 
 
96 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2330  prevent-host-death family protein  64.84 
 
 
91 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2783  prevent-host-death family protein  60.87 
 
 
96 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.686877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3875  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0867  prevent-host-death family protein  49.4 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0951251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1410  hypothetical protein  56.58 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0495  hypothetical protein  41.1 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.671507  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13710  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000922616  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4124  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000234799  hitchhiker  0.00000000380976 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2206  prevent-host-death family protein  50 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000169493  hitchhiker  0.00000000153827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0576  prevent-host-death family protein  43.01 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000390298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3301  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000616383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2209  prevent-host-death family protein  36.9 
 
 
82 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  unclonable  0.0000000000598277 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1455  prevent-host-death family protein  40 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0628  prevent-host-death family protein  42.37 
 
 
86 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000258599  unclonable  0.0000000000739074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0648  prevent-host-death family protein  42.37 
 
 
86 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000197099  unclonable  0.0000000000981851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4491  prevent-host-death family protein  42.25 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3189  prevent-host-death family protein  50.88 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1972  prevent-host-death family protein  41.79 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0345  prevent-host-death family protein  53.49 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1690  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
92 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2220  prevent-host-death family protein  41.38 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0291  hypothetical protein  40.68 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0766  prevent-host-death family protein  44.68 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0396  prevent-host-death family protein  42.55 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2255  prevent-host-death family protein  36.54 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0512  toxin-antitoxin system, antitoxin component, PHD family  40.43 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00233462 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1954  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  30.12 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2346  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.940595 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03810  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 
105 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  32.35 
 
 
87 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>