28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03810 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03810  prevent-host-death family protein  100 
 
 
88 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2346  prevent-host-death family protein  63.53 
 
 
91 aa  116  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.940595 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1954  prevent-host-death family protein  57.83 
 
 
84 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0512  toxin-antitoxin system, antitoxin component, PHD family  53.75 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00233462 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0396  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1455  prevent-host-death family protein  46.25 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13710  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000922616  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0291  hypothetical protein  47.37 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2220  prevent-host-death family protein  39.19 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4491  prevent-host-death family protein  39.24 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2209  prevent-host-death family protein  37.97 
 
 
82 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  unclonable  0.0000000000598277 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03740  hypothetical protein  51.11 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00547373  normal  0.240267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3301  prevent-host-death family protein  43.86 
 
 
82 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000616383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0576  prevent-host-death family protein  35.63 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000390298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3189  prevent-host-death family protein  40.91 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2206  prevent-host-death family protein  45.1 
 
 
90 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000169493  hitchhiker  0.00000000153827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0628  prevent-host-death family protein  33.85 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000258599  unclonable  0.0000000000739074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0648  prevent-host-death family protein  33.85 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000197099  unclonable  0.0000000000981851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4124  prevent-host-death family protein  39.34 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000234799  hitchhiker  0.00000000380976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1410  hypothetical protein  39.68 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185116  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2783  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.686877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3875  prevent-host-death family protein  34.48 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0867  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0951251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2330  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2468  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  31.94 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  39.06 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0495  hypothetical protein  30.23 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.671507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>