26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1410 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1410  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  176  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0495  hypothetical protein  54.65 
 
 
87 aa  98.6  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.671507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2468  prevent-host-death family protein  56.58 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2783  prevent-host-death family protein  52.33 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.686877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3875  prevent-host-death family protein  46.51 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2330  prevent-host-death family protein  51.69 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0867  prevent-host-death family protein  46.43 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0951251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0751  prevent-host-death family protein  50 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4124  prevent-host-death family protein  41.77 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000234799  hitchhiker  0.00000000380976 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1455  prevent-host-death family protein  40.98 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13710  prevent-host-death family protein  43.33 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000922616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0576  prevent-host-death family protein  44.87 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000390298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2206  prevent-host-death family protein  46.48 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000169493  hitchhiker  0.00000000153827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3189  prevent-host-death family protein  61.36 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4491  prevent-host-death family protein  39.24 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030165  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0291  hypothetical protein  39.19 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0628  prevent-host-death family protein  46.81 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000258599  unclonable  0.0000000000739074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0648  prevent-host-death family protein  46.81 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000197099  unclonable  0.0000000000981851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0345  prevent-host-death family protein  51.11 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2220  prevent-host-death family protein  61.29 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3301  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000616383  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2346  prevent-host-death family protein  38.96 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.940595 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03810  prevent-host-death family protein  39.68 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2209  prevent-host-death family protein  28.05 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  unclonable  0.0000000000598277 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1954  prevent-host-death family protein  31.25 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  29.41 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>