109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4768 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4768  phenylalanine 4-monooxygenase  100 
 
 		 292 aa  594  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4215  phenylalanine 4-monooxygenase  76.28 
 
 		 292 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1267  phenylalanine 4-monooxygenase  72.89 
 
 		 296 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4193  phenylalanine 4-monooxygenase  73.7 
 
 		 292 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0518  phenylalanine 4-monooxygenase  72 
 
 		 279 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261474  normal  0.0225158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0534  phenylalanine 4-monooxygenase  72 
 
 		 279 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0347  phenylalanine 4-monooxygenase  69.89 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.72687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2136  phenylalanine 4-monooxygenase  69.78 
 
 		 275 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3225  phenylalanine 4-monooxygenase  57.09 
 
 		 314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3549  phenylalanine 4-monooxygenase  56.7 
 
 		 314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3355  phenylalanine 4-monooxygenase  57.25 
 
 		 313 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3387  phenylalanine 4-monooxygenase  56.47 
 
 		 316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752001  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3533  phenylalanine 4-monooxygenase  55.17 
 
 		 310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03285  phenylalanine 4-monooxygenase  55.34 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0032  phenylalanine 4-monooxygenase  56.91 
 
 		 297 aa  288  6e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686174  hitchhiker  0.000000292031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0553  phenylalanine 4-monooxygenase  54.26 
 
 		 289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0201466  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0069  phenylalanine 4-monooxygenase  53.21 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2046  phenylalanine 4-monooxygenase  52.34 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2977  phenylalanine 4-monooxygenase  53.21 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  53.21 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227621  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3259  phenylalanine 4-monooxygenase  52.83 
 
 		 306 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0096  phenylalanine 4-monooxygenase  52.83 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0077  phenylalanine 4-monooxygenase  52.45 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0011  phenylalanine 4-monooxygenase  53.03 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1117  phenylalanine 4-monooxygenase  50.59 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3337  phenylalanine 4-monooxygenase  53.46 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  52.45 
 
 		 324 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3921  phenylalanine 4-monooxygenase  52.65 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2208  phenylalanine 4-monooxygenase  52.08 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0291015  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0168  phenylalanine 4-monooxygenase  49.21 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3383  phenylalanine 4-monooxygenase  52.24 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1616  phenylalanine 4-monooxygenase  52.24 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4001  phenylalanine 4-monooxygenase  52.24 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4075  phenylalanine 4-monooxygenase  52.24 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  52.24 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2927  phenylalanine 4-monooxygenase  52.24 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0206  phenylalanine 4-monooxygenase  52.24 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1853  phenylalanine 4-monooxygenase  47.43 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.56833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1392  phenylalanine 4-monooxygenase  46.55 
 
 		 290 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00177331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6319  phenylalanine-4-hydroxylase  47.41 
 
 		 261 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3187  phenylalanine 4-monooxygenase  48.15 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2868  phenylalanine 4-monooxygenase  46.09 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.127384  hitchhiker  0.00000000657898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1515  phenylalanine 4-monooxygenase  45.68 
 
 		 266 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.0509448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2595  phenylalanine 4-monooxygenase  46.47 
 
 		 263 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0717257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1479  phenylalanine 4-monooxygenase  45.68 
 
 		 266 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1484  phenylalanine 4-monooxygenase  45.27 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2607  phenylalanine 4-monooxygenase  47.79 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109404  hitchhiker  0.000000531063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1328  phenylalanine 4-monooxygenase  45.73 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2781  phenylalanine 4-monooxygenase  47.35 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.596236  hitchhiker  0.0000732891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2674  phenylalanine 4-monooxygenase  47.98 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.192739  hitchhiker  0.000490875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2999  phenylalanine 4-monooxygenase  43.7 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.25361  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1435  phenylalanine 4-monooxygenase  48.7 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0156707  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1386  phenylalanine 4-monooxygenase  44.44 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2108  aromatic amino acid hydroxylase  44.07 
 
 		 244 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0346551  normal  0.391634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34650  phenylalanine 4-monooxygenase  46.9 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1666  phenylalanine 4-monooxygenase  46.46 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2700  phenylalanine 4-monooxygenase  44.05 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2572  phenylalanine 4-monooxygenase  42.15 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2222  phenylalanine 4-monooxygenase  49.06 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02830  phenylalanine 4-monooxygenase  42.92 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0161825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1448  phenylalanine 4-monooxygenase  46.12 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0546255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1499  phenylalanine 4-monooxygenase  42.92 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1076  phenylalanine 4-monooxygenase  41.56 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0135613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3112  phenylalanine 4-monooxygenase  43.97 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.417382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3575  phenylalanine 4-monooxygenase  43.81 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.861489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4644  phenylalanine 4-monooxygenase  43.86 
 
 		 262 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0943506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52990  phenylalanine 4-monooxygenase  43.42 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0407  phenylalanine 4-monooxygenase  42.98 
 
 		 289 aa  185  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2930  phenylalanine 4-monooxygenase  45.29 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001480  phenylalanine-4-hydroxylase  42.45 
 
 		 264 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4490  phenylalanine 4-monooxygenase  43.24 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1424  phenylalanine 4-monooxygenase  43.24 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05421  phenylalanine 4-monooxygenase  42.35 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3779  phenylalanine 4-monooxygenase  41.2 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.736945  hitchhiker  0.000564604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3995  phenylalanine 4-monooxygenase  42.79 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1822  phenylalanine-4-hydroxylase  41.67 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3766  phenylalanine 4-monooxygenase  41.28 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1715  phenylalanine 4-monooxygenase  44.75 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00750789  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1507  phenylalanine 4-monooxygenase  39.04 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1403  phenylalanine 4-monooxygenase  38.6 
 
 		 263 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1554  phenylalanine 4-monooxygenase  41.15 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.237867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1041  phenylalanine 4-monooxygenase  41.33 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4477  phenylalanine 4-monooxygenase  32.23 
 
 		 584 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0759  phenylalanine 4-monooxygenase  32.23 
 
 		 584 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4439  phenylalanine 4-monooxygenase  32.1 
 
 		 584 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4102  phenylalanine 4-monooxygenase  31.73 
 
 		 584 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4489  phenylalanine 4-monooxygenase  32.1 
 
 		 584 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4253  phenylalanine 4-monooxygenase  31.37 
 
 		 584 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4091  phenylalanine 4-monooxygenase  31.37 
 
 		 584 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4586  phenylalanine 4-monooxygenase  31.37 
 
 		 584 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4438  phenylalanine 4-monooxygenase  31.37 
 
 		 584 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3076  phenylalanine 4-monooxygenase  32 
 
 		 585 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4205  phenylalanine 4-monooxygenase  31 
 
 		 584 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0605  aromatic amino acid hydroxylase  34.45 
 
 		 243 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2753  phenylalanine 4-monooxygenase  32.48 
 
 		 528 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2895  phenylalanine 4-monooxygenase  31.75 
 
 		 529 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518578  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  31.75 
 
 		 529 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3847  aromatic amino acid hydroxylase  33.18 
 
 		 247 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2800  phenylalanine 4-monooxygenase  31.39 
 
 		 529 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3025  phenylalanine 4-monooxygenase  30.59 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>