14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3627 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  334  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2374  hypothetical protein  31.08 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348169  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3352  hypothetical protein  28.83 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  30.63 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  30.77 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  27.63 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  27.81 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  30.87 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3582  hypothetical protein  34.29 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  28.87 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  29.41 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  27.64 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4140  hypothetical protein  27.7 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2938  hypothetical protein  27.94 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418548  normal  0.0599766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>