27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1650 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  74.9 
 
 		 244 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  75.11 
 
 		 244 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  72.8 
 
 		 244 aa  358  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  74.26 
 
 		 260 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  74.26 
 
 		 260 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  73.84 
 
 		 244 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  37.99 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  37.55 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.76 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.76 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.36 
 
 		 296 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.82 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.65 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  29.48 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  33.68 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.52 
 
 		 117 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  32.95 
 
 		 115 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25 
 
 		 118 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5735  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.38 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6488  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.38 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4843  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.72 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.77141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  30.85 
 
 		 114 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  35.78 
 
 		 114 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  30.85 
 
 		 114 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.17 
 
 		 119 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  42.4  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>