41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1442 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1442  FeoA family protein  100 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.048364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2175  FeoA family protein  54.88 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599587  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1160  FeoA family protein  61.63 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2435  FeoA family protein  56 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1470  transport protein A  59.65 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.790576  normal  0.503496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5430  hypothetical protein  46.75 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47500  FeoA-like protein  38.04 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5891  Fe2+ transport system protein A  43.21 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0622  FeoA family protein  40.26 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.459253 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1330  FeoA family protein  40.51 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0063  hypothetical protein  48.68 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.807854  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4062  FeoA family protein  48.05 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3949  FeoA family protein  48.05 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00099  ferrous iron transport protein  59.57 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194888  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1923  ferrous iron transport protein  57.14 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.957635  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1861  FeoA family protein  57.14 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4040  FeoA family protein  48.39 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_003296  RS03714  hypothetical protein  45.45 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.315414  normal  0.195727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1803  FeoA family protein  44.16 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.960085  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6109  putative FeoA family protein  49.09 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1057  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2976  hypothetical protein  48.21 
 
 		 74 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.476434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0953  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5117  FeoA family protein  50 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1110  hypothetical protein  45.9 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0675  FeoA family protein  38.55 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0317  FeoA family protein  43.4 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0769  putative ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000079809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0749  putative ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0783  ferrous iron transport protein A, putative  39.13 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0130272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0843  putative ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.923464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0714  ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0624  ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000493594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0624  ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0680  ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0602  FeoA family protein  36.96 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0653  FeoA family protein  29.49 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3828  FeoA family protein  32.47 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.902982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2012  FeoA family protein  38.1 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0630  FeoA family protein  39.13 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>