38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4062 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4062  FeoA family protein  100 
 
 		 102 aa  197  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3949  FeoA family protein  100 
 
 		 102 aa  197  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572926 
 
 
-
 
NC_003296  RS03714  hypothetical protein  83.5 
 
 		 103 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.315414  normal  0.195727 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5430  hypothetical protein  63.16 
 
 		 105 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5891  Fe2+ transport system protein A  60 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1803  FeoA family protein  64.56 
 
 		 84 aa  95.9  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.960085  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00099  ferrous iron transport protein  64.47 
 
 		 82 aa  95.9  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194888  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1923  ferrous iron transport protein  65.67 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.957635  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1861  FeoA family protein  67.16 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1160  FeoA family protein  58.73 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1442  FeoA family protein  48.05 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.048364  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47500  FeoA-like protein  43.86 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0063  hypothetical protein  48.1 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.807854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2175  FeoA family protein  56.86 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599587  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1470  transport protein A  60 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.790576  normal  0.503496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2435  FeoA family protein  56.86 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4040  FeoA family protein  44.44 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2976  hypothetical protein  45.28 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.476434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  31.63 
 
 		 844 aa  46.2  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  45.28 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1110  hypothetical protein  43.33 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  41.89 
 
 		 237 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  41.89 
 
 		 230 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0675  FeoA family protein  41.51 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0874  FeoA family protein  32.91 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  39.22 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0895  hypothetical protein  45.16 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.859474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2659  FeoA family protein  39.47 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3543  FeoA family protein  39.47 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0857  hypothetical protein  44 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577958  normal  0.227068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  39.22 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0745  FeoA family protein  33.33 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0902  FeoA family protein  35.14 
 
 		 76 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0959583  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0896  FeoA family protein  31.65 
 
 		 154 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000698283  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0622  FeoA family protein  32.91 
 
 		 81 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.459253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5085  FeoA family protein  35.21 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00192965  normal  0.334589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2697  FeoA family protein  33.9 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0855124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  38.33 
 
 		 77 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>