64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1110 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1110  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  236  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2976  hypothetical protein  87.14 
 
 
74 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.476434  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6109  putative FeoA family protein  52.63 
 
 
91 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5117  FeoA family protein  50 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0953  hypothetical protein  52.44 
 
 
93 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1057  hypothetical protein  53.66 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4040  FeoA family protein  48.48 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2450  FeoA family protein  57.14 
 
 
88 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0602  FeoA family protein  34.07 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0680  ferrous iron transport protein A  31.46 
 
 
85 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47500  FeoA-like protein  43.64 
 
 
99 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0769  putative ferrous iron transport protein A  31.46 
 
 
85 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000079809 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0624  ferrous iron transport protein A  31.46 
 
 
85 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0714  ferrous iron transport protein A  31.46 
 
 
85 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  31.46 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0783  ferrous iron transport protein A, putative  35.71 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0130272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0843  putative ferrous iron transport protein A  35.71 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.923464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0624  ferrous iron transport protein A  34.29 
 
 
85 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000493594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0630  FeoA family protein  32.58 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0749  putative ferrous iron transport protein A  34.78 
 
 
85 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5891  Fe2+ transport system protein A  48 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00099  ferrous iron transport protein  50 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1971  FeoA family protein  48.89 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0237641  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1861  FeoA family protein  50 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1923  ferrous iron transport protein  50 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.957635  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5430  hypothetical protein  47.92 
 
 
105 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1407  hypothetical protein  51.02 
 
 
82 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0063  hypothetical protein  52.08 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.807854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0895  hypothetical protein  53.66 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.859474 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0972  ferrous iron repressor  40.62 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1470  transport protein A  50 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.790576  normal  0.503496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2276  FeoA family protein  40.3 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1442  FeoA family protein  45.9 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.048364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1127  ferrous iron transport protein A  40.62 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00351255  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4062  FeoA family protein  43.33 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3949  FeoA family protein  43.33 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572926 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  35.29 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1435  hypothetical protein  37.65 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000347504  normal  0.0226993 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1750  FeoA family protein  36.11 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000170753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0109  FeoA family protein  36.9 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000157937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1803  FeoA family protein  44 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.960085  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2175  FeoA family protein  45.45 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599587  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0760  FeoA family protein  35.19 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000119012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3773  FeoA family protein  38.96 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  30.14 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2214  FeoA family protein  30.51 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  32.1 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  34.29 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  39.22 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0674  FeoA family protein  41.18 
 
 
86 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.548462  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2670  ferrous iron transport protein A, putative  30.12 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.501663  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0570  FeoA family protein  39.22 
 
 
78 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.38 
 
 
218 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1160  FeoA family protein  36.36 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108627  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0622  FeoA family protein  39.62 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.459253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  37.5 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  29.87 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2712  ferrous iron transporter A  35.09 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2585  ferrous iron transporter A  35.09 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2492  FeoA family protein  35.09 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  34.38 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  38 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  34.72 
 
 
77 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>