33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5117 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_5117  FeoA family protein  100 
 
 
96 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1057  hypothetical protein  88.54 
 
 
93 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0953  hypothetical protein  86.46 
 
 
93 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6109  putative FeoA family protein  71.6 
 
 
91 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4040  FeoA family protein  53.57 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1110  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2976  hypothetical protein  66.67 
 
 
74 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.476434  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1971  FeoA family protein  39.73 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0237641  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2175  FeoA family protein  51.02 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599587  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47500  FeoA-like protein  47.83 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1442  FeoA family protein  50 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.048364  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2435  FeoA family protein  37.5 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1160  FeoA family protein  42.62 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108627  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2450  FeoA family protein  48.94 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0769  putative ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000079809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0843  putative ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.923464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0680  ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0602  FeoA family protein  44.44 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0714  ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0624  ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000493594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0624  ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0783  ferrous iron transport protein A, putative  44.44 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0130272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0749  putative ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0630  FeoA family protein  44.44 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0063  hypothetical protein  37.04 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.807854  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1077  FeoA family protein  27.71 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00099  ferrous iron transport protein  51.11 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194888  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1470  transport protein A  46.67 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.790576  normal  0.503496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0760  FeoA family protein  31.25 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000119012  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.83 
 
 
218 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2850  hypothetical protein  44 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.921683  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1554  FeoA family protein  36.96 
 
 
74 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000033207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>