77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5891 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5891  Fe2+ transport system protein A  100 
 
 
100 aa  197  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5430  hypothetical protein  77 
 
 
105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3949  FeoA family protein  60 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572926 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4062  FeoA family protein  60 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03714  hypothetical protein  57.58 
 
 
103 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.315414  normal  0.195727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1803  FeoA family protein  60.76 
 
 
84 aa  97.1  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.960085  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00099  ferrous iron transport protein  58.67 
 
 
82 aa  94  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194888  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1861  FeoA family protein  61.76 
 
 
78 aa  83.6  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1923  ferrous iron transport protein  61.76 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.957635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47500  FeoA-like protein  40 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1442  FeoA family protein  43.21 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.048364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1470  transport protein A  54 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.790576  normal  0.503496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0063  hypothetical protein  41.18 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.807854  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1160  FeoA family protein  40 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108627  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2175  FeoA family protein  55.32 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599587  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0622  FeoA family protein  50 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.459253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2450  FeoA family protein  38.36 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  37.97 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4040  FeoA family protein  45.76 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2435  FeoA family protein  53.06 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  35.35 
 
 
844 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0745  FeoA family protein  36.84 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1330  FeoA family protein  47.06 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2976  hypothetical protein  44.44 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.476434  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1110  hypothetical protein  48 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0874  FeoA family protein  34.15 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0653  FeoA family protein  38.67 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0552  FeoA family protein  41.25 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0965  FeoA family protein  37.1 
 
 
152 aa  47  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0896  FeoA family protein  34.15 
 
 
154 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000698283  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  35.82 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0714  ferrous iron transport protein A  43.75 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  43.75 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0769  putative ferrous iron transport protein A  43.75 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000079809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  40 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0902  FeoA family protein  36 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0959583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  44.44 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0624  ferrous iron transport protein A  43.75 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0680  ferrous iron transport protein A  43.75 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0624  ferrous iron transport protein A  43.75 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000493594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0783  ferrous iron transport protein A, putative  43.75 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0130272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0749  putative ferrous iron transport protein A  43.75 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0843  putative ferrous iron transport protein A  43.75 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.923464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0675  FeoA family protein  42.86 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1750  FeoA family protein  38.18 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000170753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0602  FeoA family protein  43.75 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  40 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3543  FeoA family protein  36.36 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  44.23 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1972  FeoA family protein  31.17 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.363533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  45.1 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2492  FeoA family protein  44.23 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  46.94 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  42.31 
 
 
77 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5085  FeoA family protein  36.84 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00192965  normal  0.334589 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  36.26 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0674  FeoA family protein  37.93 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.548462  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  39.62 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0622  FeoA family protein  30.26 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.927847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2697  FeoA family protein  34.43 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0855124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0317  FeoA family protein  41.18 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585031  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0961  FeoA family protein  32.35 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1621  FeoA family protein  32.47 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.453732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0630  FeoA family protein  43.75 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0013  FeoA family protein  38.18 
 
 
85 aa  42  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3828  FeoA family protein  33.77 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.902982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4235  FeoA family protein  35.62 
 
 
74 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.679143  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1138  FeoA family protein  36 
 
 
80 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1740  FeoA family protein  32.98 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0361183  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0662  putative Fe2+ transport protein  39.22 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2850  hypothetical protein  38.96 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.921683  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03985  probable ferrous iron transport protein A  27.27 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1016  FeoA family protein  34.55 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83545 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1971  FeoA family protein  41.18 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0237641  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.22 
 
 
218 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0753  FeoA family protein  35.53 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000372394  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1952  FeoA family protein  41.67 
 
 
79 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000344401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>