19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1330 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1330  FeoA family protein  100 
 
 
81 aa  166  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0622  FeoA family protein  76.54 
 
 
81 aa  133  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.459253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1442  FeoA family protein  40.51 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.048364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1470  transport protein A  50.94 
 
 
72 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.790576  normal  0.503496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1160  FeoA family protein  48.98 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108627  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2175  FeoA family protein  48.98 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599587  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2435  FeoA family protein  46.81 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5891  Fe2+ transport system protein A  47.06 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1861  FeoA family protein  42.86 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1923  ferrous iron transport protein  42.86 
 
 
78 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.957635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00099  ferrous iron transport protein  36.76 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0063  hypothetical protein  38.24 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.807854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1803  FeoA family protein  33.75 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.960085  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2808  FeoA family protein  33.33 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2012  FeoA family protein  35.19 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5430  hypothetical protein  39.22 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2276  FeoA family protein  37.68 
 
 
84 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2850  hypothetical protein  32.91 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.921683  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03714  hypothetical protein  34.67 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.315414  normal  0.195727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>