32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03714 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03714  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  201  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.315414  normal  0.195727 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4062  FeoA family protein  83.5 
 
 
102 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3949  FeoA family protein  83.5 
 
 
102 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572926 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5430  hypothetical protein  61.7 
 
 
105 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5891  Fe2+ transport system protein A  57.58 
 
 
100 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00099  ferrous iron transport protein  61.84 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194888  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1803  FeoA family protein  60.24 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.960085  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1861  FeoA family protein  65.67 
 
 
78 aa  90.1  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1923  ferrous iron transport protein  64.18 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.957635  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1160  FeoA family protein  57.14 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108627  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2175  FeoA family protein  56.86 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599587  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0063  hypothetical protein  48.1 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.807854  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1442  FeoA family protein  45.45 
 
 
116 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.048364  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47500  FeoA-like protein  44 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1470  transport protein A  56 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.790576  normal  0.503496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2435  FeoA family protein  54.9 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0895  hypothetical protein  46.77 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.859474 
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  32.56 
 
 
844 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4040  FeoA family protein  44.07 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3543  FeoA family protein  39.47 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  45.28 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0675  FeoA family protein  41.51 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0874  FeoA family protein  30.68 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  40.54 
 
 
237 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1507  FeoA family protein  35.53 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.103375  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2976  hypothetical protein  43.4 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.476434  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0622  FeoA family protein  34.67 
 
 
81 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.459253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  40.54 
 
 
230 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1330  FeoA family protein  34.67 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0896  FeoA family protein  29.55 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000698283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  39.22 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0745  FeoA family protein  34.67 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.445851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>