33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0953 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0953  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1057  hypothetical protein  94.62 
 
 		 93 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5117  FeoA family protein  86.46 
 
 		 96 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6109  putative FeoA family protein  69.14 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4040  FeoA family protein  53.26 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1110  hypothetical protein  52.44 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2976  hypothetical protein  64.71 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.476434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2175  FeoA family protein  50 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599587  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47500  FeoA-like protein  47.83 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1971  FeoA family protein  38.36 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0237641  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1160  FeoA family protein  42.62 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1442  FeoA family protein  47.83 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.048364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0749  putative ferrous iron transport protein A  46.67 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0843  putative ferrous iron transport protein A  46.67 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.923464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  46.67 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0769  putative ferrous iron transport protein A  46.67 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000079809 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0680  ferrous iron transport protein A  46.67 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0602  FeoA family protein  46.67 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2450  FeoA family protein  46.81 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0714  ferrous iron transport protein A  46.67 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0624  ferrous iron transport protein A  46.67 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000493594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0624  ferrous iron transport protein A  46.67 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0783  ferrous iron transport protein A, putative  46.67 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0130272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0630  FeoA family protein  46.67 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2435  FeoA family protein  46.67 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1077  FeoA family protein  27.71 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1470  transport protein A  44.44 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.790576  normal  0.503496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00099  ferrous iron transport protein  48.89 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194888  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0760  FeoA family protein  37.25 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000119012  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1554  FeoA family protein  39.13 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000033207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0063  hypothetical protein  44.44 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.807854  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2850  hypothetical protein  42 
 
 		 85 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.921683  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.75 
 
 		 218 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>