24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2450 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2450  FeoA family protein  100 
 
 
88 aa  174  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2850  hypothetical protein  48.1 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.921683  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2986  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.504465  normal  0.0376012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1110  hypothetical protein  57.14 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2976  hypothetical protein  46.97 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.476434  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5430  hypothetical protein  39.73 
 
 
105 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4040  FeoA family protein  56.25 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5891  Fe2+ transport system protein A  38.36 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1803  FeoA family protein  34.67 
 
 
84 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.960085  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1057  hypothetical protein  48.94 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0953  hypothetical protein  46.81 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6109  putative FeoA family protein  53.19 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2175  FeoA family protein  41.46 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599587  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5117  FeoA family protein  48.94 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1861  FeoA family protein  34.25 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1923  ferrous iron transport protein  34.25 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.957635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00099  ferrous iron transport protein  38.16 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194888  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1470  transport protein A  47.06 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.790576  normal  0.503496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1160  FeoA family protein  36.71 
 
 
105 aa  42  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108627  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0602  FeoA family protein  37.68 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2435  FeoA family protein  35.63 
 
 
97 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0965  FeoA family protein  36 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0630  FeoA family protein  35.48 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0063  hypothetical protein  45.83 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.807854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>