104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2012 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2012  FeoA family protein  100 
 
 
81 aa  157  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0317  FeoA family protein  41.25 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585031  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0674  FeoA family protein  46.05 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.548462  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0013  FeoA family protein  41.67 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1621  FeoA family protein  40.28 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.453732  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  38.16 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1750  FeoA family protein  40.28 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000170753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1407  hypothetical protein  45.95 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02720  Ferrous iron transport protein FeoA  41.67 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0680  ferrous iron transport protein A  34.21 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0624  ferrous iron transport protein A  34.21 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0714  ferrous iron transport protein A  34.21 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  42.86 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2492  FeoA family protein  40.85 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0769  putative ferrous iron transport protein A  34.21 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000079809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1971  FeoA family protein  47.73 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0237641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2276  FeoA family protein  48 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0630  FeoA family protein  34.21 
 
 
85 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  32.89 
 
 
85 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0783  ferrous iron transport protein A, putative  32.89 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0130272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0624  ferrous iron transport protein A  32.89 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000493594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0843  putative ferrous iron transport protein A  32.89 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.923464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0749  putative ferrous iron transport protein A  32.89 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0602  FeoA family protein  38 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  39.73 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2670  ferrous iron transport protein A, putative  39.13 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.501663  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1016  FeoA family protein  39.47 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  36.73 
 
 
82 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1435  hypothetical protein  40.58 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000347504  normal  0.0226993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0895  hypothetical protein  41.33 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.859474 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2718  FeoA family protein  36.62 
 
 
89 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641042  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0760  FeoA family protein  32.47 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000119012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0552  FeoA family protein  40.74 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2214  FeoA family protein  40.85 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  39.47 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  34.25 
 
 
73 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  36.62 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1708  hypothetical protein  32.89 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2189  FeoA family protein  33.78 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000240833  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  39.73 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3837  FeoA family protein  32.88 
 
 
86 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  38.03 
 
 
844 aa  46.2  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  37.5 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1138  FeoA family protein  37.5 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908458  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  36.62 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  35.62 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0883  Fe2+ transport system protein A  34.72 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000745699  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  39.44 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  37.5 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1740  FeoA family protein  32.26 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0361183  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0972  FeoA family protein  47.92 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0271378 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  36.99 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0260  FeoA family protein  36.11 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00349383  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1960  ferrous iron transport protein A  34.72 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2697  FeoA family protein  35.14 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0855124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  37.88 
 
 
94 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  34.25 
 
 
784 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1210  FeoA family protein  43.28 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  35.14 
 
 
310 aa  44.3  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  36.62 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0238  ferrous iron transport protein A  34.72 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1730  FeoA family protein  30.56 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285273  normal  0.0385083 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0645  FeoA family protein  37.5 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.967049  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1330  FeoA family protein  35.19 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  32.39 
 
 
829 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  30.56 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3828  FeoA family protein  37.5 
 
 
71 aa  42.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.902982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  30.56 
 
 
848 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0106  FeoA family protein  36 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  32.88 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  40.79 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1403  hypothetical protein  32.05 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000019966  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0874  FeoA family protein  36 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0896  FeoA family protein  36 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000698283  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  46.94 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  32 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4235  FeoA family protein  48.94 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.679143  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  33.33 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2064  ferrous iron transport protein A  33.33 
 
 
74 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  33.33 
 
 
79 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  33.33 
 
 
79 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  36.11 
 
 
117 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1267  FeoA family protein  42.55 
 
 
83 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  36.62 
 
 
88 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1554  FeoA family protein  31.43 
 
 
74 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000033207  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03985  probable ferrous iron transport protein A  29.85 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  37.5 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4628  ferrous iron transport protein A  36.51 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1923  ferrous iron transport protein  40 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.957635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2327  FeoA family protein  40.32 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  37.5 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0343  FeoA family protein  33.8 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0183501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  36.73 
 
 
785 aa  41.2  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0109  FeoA family protein  38.03 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000157937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3778  ferrous iron transport protein A  34.92 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3812  ferrous iron transport protein A  34.92 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3703  ferrous iron transport protein A  34.92 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3706  ferrous iron transport protein A  34.92 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3874  ferrous iron transport protein A  34.92 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1442  FeoA family protein  38.1 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.048364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>