36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0338 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  100 
 
 		 427 aa  849    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  28.47 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  25.18 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  24.88 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  25.18 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 421 aa  143  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  23.51 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 207 aa  114  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  24.64 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 448 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  25.7 
 
 		 461 aa  86.7  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  23.35 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  23.35 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  23.53 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  22.41 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  22.47 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  23.25 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  21.63 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 440 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 439 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  22.39 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 428 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  25 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>