31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1223 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1223  outer membrane protein A precursor  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000983435  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05474  hypothetical protein  45.12 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  28.1 
 
 		 376 aa  48.9  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  27.4 
 
 		 351 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4206  virulence-related outer membrane protein  31.76 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  29.67 
 
 		 355 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  29.67 
 
 		 354 aa  46.2  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  29.91 
 
 		 346 aa  45.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  29.91 
 
 		 346 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  29.91 
 
 		 365 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  29.91 
 
 		 346 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  29.91 
 
 		 346 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.91 
 
 		 346 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  29.82 
 
 		 350 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  29.91 
 
 		 354 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  28.39 
 
 		 367 aa  45.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  35.71 
 
 		 341 aa  45.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  29.36 
 
 		 358 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  29.36 
 
 		 369 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  29.36 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  29.61 
 
 		 367 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  29.82 
 
 		 358 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  26.11 
 
 		 377 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000299  accessory colonization factor AcfA  29.79 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0418027  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  29.36 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  28.9 
 
 		 371 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003546  hypothetical protein  31.37 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0563  putative lipoprotein  26.28 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  26.62 
 
 		 373 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  26 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  27.19 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>