26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001243 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001243  substrate-specific component MtsA of methionine-regulated ECF transporter  100 
 
 
182 aa  355  2.9999999999999997e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05109  hypothetical protein  98.35 
 
 
182 aa  349  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1988  hypothetical protein  82.97 
 
 
183 aa  301  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0978755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2500  hypothetical protein  40.45 
 
 
182 aa  131  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00984569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2665  hypothetical protein  40.45 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2659  hypothetical protein  40.45 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.407777  hitchhiker  0.00000362909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2667  hypothetical protein  40.45 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00757305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2708  hypothetical protein  39.89 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2384  hypothetical protein  39.33 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.628476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2657  hypothetical protein  39.33 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000063356 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2423  hypothetical protein  39.33 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2640  hypothetical protein  39.33 
 
 
182 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2460  hypothetical protein  39.33 
 
 
182 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0258676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0367  hypothetical protein  42.86 
 
 
188 aa  115  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0346  hypothetical protein  39.78 
 
 
181 aa  109  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1836  hypothetical protein  37.84 
 
 
185 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1556  hypothetical protein  36.56 
 
 
185 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381762  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1634  hypothetical protein  38.76 
 
 
212 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00356252  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1499  hypothetical protein  38.59 
 
 
185 aa  100  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.494823  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2709  hypothetical protein  34.97 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2766  hypothetical protein  34.97 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302276  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1974  hypothetical protein  39.56 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.352822  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07640  predicted membrane protein  35.23 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.532063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8787  hypothetical protein  38.68 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1534  hypothetical protein  33.82 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.204785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2095  hypothetical protein  42.37 
 
 
166 aa  41.6  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000837407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>