More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0824 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  100 
 
 
336 aa  697    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  69.69 
 
 
336 aa  475  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  67.78 
 
 
345 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  53.43 
 
 
348 aa  340  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  48.84 
 
 
344 aa  309  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  50.15 
 
 
325 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  49.85 
 
 
325 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  48.76 
 
 
325 aa  285  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  51.11 
 
 
311 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  49.21 
 
 
311 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  47.63 
 
 
311 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  46.37 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  47.83 
 
 
316 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  44.95 
 
 
322 aa  248  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  45.05 
 
 
315 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  45.71 
 
 
315 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  44.8 
 
 
334 aa  236  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  41.25 
 
 
326 aa  235  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  42.55 
 
 
312 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  40 
 
 
358 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  41.94 
 
 
319 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  44.84 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  43.17 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  41.29 
 
 
319 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  43.17 
 
 
313 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  43.17 
 
 
313 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  42.86 
 
 
313 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  42.86 
 
 
313 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  39.31 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  40.3 
 
 
363 aa  209  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  42.77 
 
 
323 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  42.2 
 
 
325 aa  205  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  43.03 
 
 
329 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  41.88 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  38.35 
 
 
333 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  42.91 
 
 
348 aa  192  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  37.14 
 
 
322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  35.22 
 
 
311 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  35.22 
 
 
311 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  35.51 
 
 
311 aa  150  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.79 
 
 
316 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.94 
 
 
316 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  27.7 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  28.05 
 
 
332 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.95 
 
 
267 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.94 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  27.11 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  26.74 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  26.74 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  26.74 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  26.74 
 
 
323 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  26.74 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  26.62 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  26.74 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  26.37 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  26.74 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  25.91 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  26.51 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0925  putative agmatinase  25.33 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1823  putative agmatinase  27.03 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.397511  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  24.52 
 
 
369 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  27.96 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  27.96 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  27.96 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.49 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  26.33 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  24.37 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  26.33 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  26.33 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  25.41 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  23.95 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  23.03 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  23.03 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  23.03 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  25.45 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0745  agmatinase  27.91 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00217133  hitchhiker  0.00435081 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  28.77 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.24 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.14 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  24.42 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  27.39 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  26.91 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  24.76 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  22.79 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  25 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  25 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  25 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  25 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  23.78 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  24.35 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  23.78 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  25.84 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.23 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4509  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.48 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  25 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  25.62 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  25.46 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  25 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  25 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  25 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>